故事主要是围绕着主角芭月凉的父亲芭月巌过去在中国取得的两面石镜(龙镜、凤凰镜)展开。在儿子18岁生日当天,身为芭月武馆之道场主的芭月巌被一个来自中国的武术高手蓝帝杀害,龙镜亦被夺走。当面目睹惨剧的芭月凉誓要为父报仇,追随着蓝帝的足迹前往香港及中国大陆。凉在旅途中遇到了各种各样的人,构筑着复杂的人际关系,并渐渐揭开谜团。
章节安排
在2017年的访谈中,制作人铃木裕说明他所创作的莎木原始故事共有十一个章节。第一章即为首作《莎木 一章 横须贺》,讲述凉如何追寻着蓝帝的踪迹,进而启程前往香港。《莎木II》的故事自香港展开,其内容约80%源自第二章,其余20%取自第四至六章的部分情节,原本的第三章则被完全删除。
莎木 一章 横须贺
故事开始在1986年11月29日的横须贺市,主角芭月凉赶回芭月武馆后发现有组不速之客闯入,其中带头者“蓝帝”正和父亲芭月巌对峙要巌交出石镜。芭月巌在交锋中受到了蓝帝的重击,却仍然不肯交代石镜的下落。凉愤而出手,但反被蓝帝打伤并用其生命要胁巌;为了保住儿子,巌只能屈服说出石镜所在。
在手下找到龙镜后,蓝帝问巌是否还记得赵孙明,并直指赵是因巌而死,为此要巌以一个武术家的身份来面对死亡。巌受到致命一击后,蓝帝等人就离开了芭月武馆。巌对凉交代了遗言“拥有值得去爱的朋友”后,随即离开了人世。
数日后,凉的身体得到恢复,他觉得自己有责任为父亲的死报仇,于是开始在出身地“桜ヶ丘(Sakuragaoka)”探索,搜集当天闯入武馆那一组人的情报。
凉通过询问邻居与好友,逐渐找到了些蛛丝马迹。在解读过一封寄给巌并以谜样中文写成的信后,凉判断应该去找信中言及的“陈大人”,信上署名为朱元达的人物也提到了镜子的存在。经由陈大人及其子陈贵章的帮助,凉找到了埋藏在家中地下室的另外一块石镜——凤凰镜,并得知蓝帝所属的中国黑帮“蚩尤门”与当地的黑社会组织“Mad Angels”有联系。为了接近Mad Angels,凉开始在新横须贺港找工作,暗中调查。
凉通过好友介绍,在新横须贺港找到了份开堆高机的打工。但凉在工作时惹了不少麻烦,导致Mad Angels绑架了凉的好友原崎望,并要求凉打倒组织的眼中钉贵章来换回原崎,最终凉与贵章合作一齐解决了Mad Angels的70名喽啰。擒获的头目透露蓝帝已离开日本前往香港,凉找到蓝帝的希望再次落空。
在陈大人的帮助下,凉终于坐上开往香港的轮船。上船前,陈大人把一封介绍信给了凉,让他到香港后去寻求一位“桃李少”老师的支持,以便找到或许握有内情的朱元达。
莎木II
时间推进到1987年,一开场主角凉便抵达香港,探寻一章结尾陈大人介绍的“桃李少”老师,这位神秘的桃李少是凉找寻朱元达进而抓到蓝帝的唯一线索。经过一番奔走后,凉终于和在文武庙任教的桃李少碰面,原来桃是本名为红秀瑛的女性武术家。因为凉的目的是不计后果的复仇,故秀瑛并不愿意让凉见到朱元达,但依然不时在背后暗中相助。
打探中凉认识了可能帮助他找到蓝帝的人——刃武鹰,他是街头帮派“Heavens”的头目。刃看中在神秘凤凰镜背后或许隐藏着大笔金钱利益,于是决定协助凉。在香港时,凉与刃、少年翁、大胆热情的女生Joy一行有着诸多牵扯,而凉也在秀瑛的指点下对武艺有了一番精进。
在刃的指引下,凉来到了香港的九龙城,寻找曾寄信给芭月巌的朱元达。同时,黄天会也在谋划着如何为蓝帝捉到朱元达。借着朱元达部下的帮助,凉和刃终于见到了朱元达,却不知已被黄天会的头目斗牛所跟踪,斗牛一伙尾随赶到后凉寡不敌众,朱元达也被掳走。
为救出朱元达,凉经由打黑市拳的连胜来探问门路,和伙伴潜入了黄天会的据点——九龙城中的黄天楼。凉在黄天楼顶与斗牛进行战斗,阻止了蓝帝带走朱元达,但蓝帝也乘直升机遁走了。回到居住地,朱元达揭示了芭月巌被杀的原因,并提供了凤凰镜的关键信息。他建议凉去两枚石镜的制造地——桂林白鹿村作进一步搜索。凉于与刃、Joy、翁、秀瑛道别后往桂林出发。
抵达桂林后不久,凉就遇到了在一章里多次出现在梦中的少女玲莎花,探访中得知莎花一家与凤凰镜的来历有密切关联。莎花带凉到白鹿村近郊的一个采石场去见她的父亲,但是矿洞里只剩下父亲留下的一封信与一口剑。在两人合力下以剑与凤凰镜触发了机关,火光照亮了整个矿洞,显现在石壁上的正是凤凰镜与龙镜的巨大石雕。剑浮上了空中,两人望着剑,游戏便到此结束,为玩家留下了悬念。
莎木III
莎木III承接上一代结尾,凉与莎花来到了莎花父亲袁师傅工作的采石场,却发现父亲失踪。为了寻找袁师傅的下落,莎花和凉在白鹿村打听石雕师的线索,途中凉知道了其父亲芭月巌与赵孙明的关系,也知道了凤凰镜的历史。凉在探索路上不断遇到磨炼,在得知袁师傅被带到漓江沿岸的港口城市鸟舞后,凉和莎花便出发前往鸟舞寻找袁师傅,同时追寻杀父仇人蓝帝、凤凰镜以及自己身世的秘密。
芭月巌、蓝帝与镜
从朱元达口中得知,蓝帝(本名赵龙孙)深信是芭月巌杀害了自己的父亲赵孙明,为了复仇故杀死了芭月巌。赵孙明是朱的挚友,也是一位出色的武术家。朱元达不相信芭月巌会杀人,但朱也不知道当时的实情,只知道赵孙明死了,然后巌把原为赵孙明所有的两面镜带回了日本。
龙镜与凤凰镜由桂林白鹿村的洮河绿石制成,是一对能开启清朝宝藏的钥匙。只有当两面镜都具备的时候,才能找到宝藏的所在。