本作主要剧情紧接上一作《传颂之物 虚伪的假面》展开。奥修特尔同武赖在最终决斗中同归于尽,并将一切托付给了前作主角哈克(白)。哈克经过考量,决定戴上奥修特尔的假面,开始假扮奥修特尔进行活动。他的活动得到了奥修特尔的妹妹猫音的帮助。最终,哈克一行人带皇女杏树回到了奥修特尔的故乡恩纳卡姆依。但皇女杏树却因为被下毒而无法开口说话。另一方面,前作的女主角久远回到了祖国图斯库尔。她的真实身份是图斯库尔的皇女。在身体恢复后,与父亲胧争执一番的久远决定妥协,率领图斯库尔之兵出征大和,但实际上却暗中为哈克所在的恩纳卡姆依提供援助。杏树因久远提供的药物,身体得到恢复。尊重她意愿的哈克等人决定帮助杏树复国。虽然最初一战取得胜利,但恩纳卡姆依终因盘踞帝都,拥立假皇女的雷光的计略而陷入困境。
在恩纳卡姆依陷入绝境时,久远隐藏真实身份,以图斯库尔皇女的身份访问恩纳卡姆依,并在贝纳威和克罗两人的默许下回到哈克一行人身边。与此同时,局势也获得突破,哈克一行人成功与露露缇耶所属的九重里国建立联系,并在一番风波后恢复交往。回到恩纳卡姆后,哈克等人又先后收复了伊兹鲁哈和纳克库两国,但纳克库通往帝都的大桥却在战斗中被毁,集合在杏树名下的联合军不得不走远路与盘踞帝都的雷公军进行决战。最终,夺回帝都的战斗以意想不到的方式结束,但在战争中,哈克因多次使用假面,灵魂的力量几乎耗尽,再使用假面将会因此而死。
大和重归和平后,哈克在一天晚上突然受到帝的妻子穗香的召唤,在帝都地下设施中见到了并未身亡,但只能生活在容器中的帝。哈克和久远亦受到帝的拜托,前往图斯库尔寻找主钥匙(Master Key)。经过图斯库尔方面介绍,两人来到图斯库尔地下神殿中,见到了被封印的哈克奥罗(第一作主角,同时也是大神解放者),以及留在此地守护、持有主钥匙的艾露露。在艾露露准备将主钥匙交给哈克和久远时,在前作中谋杀帝的主谋者沃西斯在此时出现,抢走了主钥匙。因为沃西斯天真的想法,意图用天照消灭被帝封存、成为失去理性的前人类们,结果导致帝都被毁灭,大和险些因为天照机能停止而陷入永冬。哈克等人在图斯库尔方面的帮助下杀死了变成魔物的沃西斯,但哈克也因为使用假面耗尽了灵魂的力量而死亡。因哈克的死受到刺激的久远无法抑制住情绪,激活了大神解放者的血液,变成了解放者。众人想要救回久远,但却无能为力。此时,哈克通过哈克奥罗假面的力量复活,重返众人身边,与众人一同通过战斗击败了大神解放者,救回了久远。但在一切结束后,哈克又再度消失。
久远成为图斯库尔的女皇,与杏树的大和缔结和平条约,建立了长久的友谊。哈克则是继承了哈克奥罗的位置,成为了类似于神的存在,默默守护久远等人。哈克奥罗得偿所愿,成为了一个普通人类,与艾露露重逢。